Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmnb1P14733 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmnb1P14733 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms