Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms