Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms