Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DffaO54786 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DffaO54786 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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DffaO54786 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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