Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ColqO35348 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ColqO35348 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ColqO35348 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ColqO35348 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms