Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sec22bO08547 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sec22bO08547 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms