Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20939L7N243 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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