Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21310J3QQ23 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21310J3QQ23 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm21310J3QQ23 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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