Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm5225J3QPL3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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