Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn34c3J3QJW5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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