Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21060J3KMU4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21060J3KMU4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms