Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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