Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc175E9PVB3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms