Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zscan18E9PUD6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms