Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rdh8D3Z6W3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rdh8D3Z6W3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms