Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms