Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Samd1D3YXK1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Samd1D3YXK1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samd1D3YXK1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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