Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm17333C6EQI3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17333C6EQI3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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