Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr29B1ARI9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms