Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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