Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms