Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm3550W4VSN7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms