Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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CcniQ9Z2V9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CcniQ9Z2V9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CcniQ9Z2V9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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CcniQ9Z2V9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CcniQ9Z2V9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CcniQ9Z2V9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CcniQ9Z2V9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CcniQ9Z2V9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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CcniQ9Z2V9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CcniQ9Z2V9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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CcniQ9Z2V9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CcniQ9Z2V9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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