Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms