Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AmfrQ9R049 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AmfrQ9R049 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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