Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms