Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Chrac1Q9JKP8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms