Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc28a3Q9ERH8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc28a3Q9ERH8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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