Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rarres2Q9DD06 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rarres2Q9DD06 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms