Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hmg20aQ9DC33 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms