Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms