Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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