Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem88Q9D0N8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms