Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccdc47Q9D024 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccdc47Q9D024 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc47Q9D024 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccdc47Q9D024 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc47Q9D024 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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