Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PmpcbQ9CXT8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PmpcbQ9CXT8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PmpcbQ9CXT8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms