Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CWU4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms