Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd12Q9CWU0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms