Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BccipQ9CWI3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BccipQ9CWI3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BccipQ9CWI3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BccipQ9CWI3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BccipQ9CWI3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BccipQ9CWI3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms