Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg3Q9CPX6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms