Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms