Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim3Q99PE5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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