Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms