Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SrrtQ99MR6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrrtQ99MR6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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