Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tm2d1Q99MB3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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