Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gdpd3Q99LY2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gdpd3Q99LY2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms