Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RtcbQ99LF4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RtcbQ99LF4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms