Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lims1Q99JW4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lims1Q99JW4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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