Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm1Q8K377 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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