Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms