Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trappc12Q8K2L8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc12Q8K2L8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms